Die meisten Referenzgewässer für die Flusstypen Ostwestfalens erfüllen nur teilweise den Annspruch eines naturnahen Fließgewässers hinsichtlich Morphologie, Wasserqualität, Wasserführung, Besiedlung und Gewässerumfeld. Einzelne Gewässer- und Auenstrukturen wie naturnahes Sohlsubstrat, Uferbänke, Hochflutrinnen oder Altgewässer, die zum typischen Formenschatz des entsprechenden Gewässertyps gehören, sind allerdings noch an einigen Gewässerabschnitten zu finden. Als Referenzstrukturen können sie einen Eindruck der potentiell natürlichen Gewässer-morphologie vermitteln.

In der nachfolgen Tabelle werden die Flusstypen zur groben Orientierung ebenfalls den Gewässer-landschaften zugeordnet. Dies ist typologisch jedoch nicht mehr eindeutig.

Fließgewässer- landschaft	Flusstyp	Referenz- gewässer
Sandgebiete	Sandgeprägter Fluss des Tieflandes	Ems
Verwitterungs- gebiete
Lößgebiete
Niederungsgebiete	Organisch geprägter oder Sandgeprägter Fluss des Tieflandes	Große_Aue
Schwach-karbonatisches Deckgebirge	Kiesgeprägter Fluss des Deckgebirges	Bega Else Emmer Nethe Werre
Muschelkalkgebiet	Kiesgeprägter Fluss des Deckgebirges	Nethe
Verkarstetes Kalkgebiet	Schottergeprägter Karstfluss des Deckgebirges	Alme Altenau

Weitere Abschnitte dieser Flusstypen mit naturnahen Strukturen lassen sich über die nachfolgende Tabelle anwählen:

Fließgewässer- landschaft	Gewässertyp	Beispiel
Sandgebiete	Sandgeprägter Fluss des Tieflandes
Niederungsgebiete	Sandgeprägter Fluss des Tieflandes
Schwach-karbonatisches Deckgebirge	Kiesgeprägter Fluss des Deckgebirges
Muschelkalkgebiet	Kiesgeprägter Fluss des Deckgebirges
Verkarstetes Kalkgebiet	Schottergeprägter Karstfluss des Deckgebirges